Desde então, venho salvando os arquivos gerados em layers temporários sempre que eles forem produtos intermediários, de natureza auxiliar ao processo principal que eu estou executando. Dessa forma, eles são excluídos automaticamente depois que eu sair do QGIS (ou ao reiniciar o computador), então não preciso me preocupar com eles depois de executar meu código. Bom, decidi fazer um post com um resumo de como eu salvo as saídas das ferramentas executadas no PyQGIS em camadas temporárias, caso isso venha a ser útil para alguém!
Este erro é especialmente comum quando você está executando novamente um código que já executou anteriormente. Às vezes, enquanto estou programando, executo uma versão incompleta do meu código, só para ver se o compilador/interpretador acusa algum erro até ali. Os meus códigos freqüentemente incluem a abertura e/ou salvamento de arquivos no disco rígido. Em um dos meus códigos, eu pensava que o arquivo em questão seria sobrescrito toda vez que eu executasse um salvamento de arquivo no Console Python do QGIS.
ERROR 1: Attempt to write non-multipoint (POINT) geometry to multipoint shapefile. ERROR 1: Unable to write feature 0 from layer points_layer. ERROR 1: Terminating translation prematurely after failed translation of layer points_layer (use -skipfailures to skip errors)